El análisis de heces se utiliza, por lo general, en el  diagnóstico del cáncer colorrectal. Además, puede detectar otras afecciones en el tracto digestivo, úlceras, enfermedades inflamatorias intestinales, pólipos, hemorroides y diverticulosis. Este examen se utiliza generalmente para diagnosticar cáncer colorrectal antes de la presencia de otros síntomas. Además, puede detectar otras infecciones en el tracto digestivo. Existen otras situaciones como la anemia, la enfermedad inflamatoria intestinal y el síndrome de intestino irritable, en las que también puede ser productivo este tipo de análisis.